公立醫(yī)院收入主要有以下4個部分：醫(yī)療服務收入、檢查收入、藥品耗材收入和財政補貼。顯然，破除“以藥養(yǎng)醫(yī)”，指的是藥品收益不再是醫(yī)院補償資金來源。政策意圖顯然不是用檢查和耗材收入替代藥品收入，那剩下的補償資金來源就只有增加醫(yī)療服務收入和增加財政補貼了。

通過增加財政補貼來消除“以藥養(yǎng)醫(yī)”是過去三年基層醫(yī)改的思路，基本藥物零差價制度也是這個思路，但是這個做法有待商榷，部分原因是地方政府、沒有意愿也沒有能力增加財政補貼，根本原因則是財政養(yǎng)醫(yī)導致論資排輩的平均主義大鍋飯分配制度，顯著降低了醫(yī)務人員的工作積極性，加劇了城鄉(xiāng)居民的看病難的困境。新的縣級公立醫(yī)院改革方案不再要求由財政來負責醫(yī)務人員的薪酬，因此，破除“以藥養(yǎng)醫(yī)”就需要配套方案，以提高醫(yī)療服務價格和改革醫(yī)保付費方式。

大致說來，若要真正破除“以藥養(yǎng)醫(yī)”，按照目前的水平，醫(yī)院的藥品收入大致還應擠壓掉40%左右（15%+返利+回扣）的水分。與此同時，總體上醫(yī)院的醫(yī)療服務收費要大致翻一番左右，才能真正實現(xiàn)“以醫(yī)養(yǎng)醫(yī)”。

需要指出的是，醫(yī)院這種收入結構的調(diào)整，并不會增加患者和醫(yī)保的經(jīng)濟負擔。醫(yī)院收入的這種“平移”意味著公立醫(yī)院收入結構的根本性變化，意味著公立醫(yī)院收入開始走向規(guī)范化和透明化，問題是醫(yī)務人員收入部分能否同樣走向規(guī)范化和透明化？進一步的問題是，公立醫(yī)院能否真正獲得收入分配自主權和必須與之配套的用人自主權，以建立規(guī)范透明的“多勞多得，優(yōu)績優(yōu)酬”制度。而如果醫(yī)院的實際收入分配走向了論資排輩的平均主義大鍋飯制度，醫(yī)院如何保證效率？

基于同樣的道理，醫(yī)保付費機制改革也會遭遇類似困境。總額預付、DRGs、按人頭付費等新型醫(yī)保付費方式的基本原理是，在保持醫(yī)院總收入水平不下降的條件下激勵醫(yī)院及其醫(yī)生盡可能減少不必要的浪費，控制醫(yī)療成本。問題是，這些由醫(yī)生努力降低成本增加的盈余可以全部分配給醫(yī)務人員嗎？能形成公開透明的收入差距嗎？如果答案是不能，那醫(yī)生為什么要以犧牲自己的回扣收入為代價（醫(yī)院則以犧牲返利為代價）來降低藥品和耗材費用呢？如果醫(yī)生和醫(yī)院沒有降低醫(yī)藥成本的動力，新型醫(yī)保付費方式改革又有什么意義？

也就是說，若要新型醫(yī)保付費方式有效發(fā)揮作用，有賴于公立醫(yī)院收入分配制度的改革，這同樣面臨前述醫(yī)療服務價格提高帶來的一系列問題。這就涉及到了更深入一步的問題：如何建立和完善公立醫(yī)院法人治理機制？

上述問題最后都歸結為一個問題，我們能夠在公立醫(yī)院壟斷醫(yī)療服務供給的條件下完成上面的改革嗎？